Качество высшего образования является показателем уровня и успешности вуза. Качество высшего образования Жилинского университета регулируется внутренней системой обеспечения качества образования, которая была создана в соответствии с требованиями поправки (закон № 455/2012 Свода законов.) к Закону №. 131/2002 Свода законов о высшем образовании и о внесении изменений и дополнений в некоторые законодательные акты (Закон о высшем образовании) с учетом областей, определенных „ESG“ (Стандартами и руководствами для обеспечения качества высшего образования в Европейском пространстве высшего образования). Внутренняя система обеспечения качества образования основывается на долгосрочном плане Жилинского университета на 2014-2020 годы и при его создании использовались результаты и опыт использования систем менеджмента качества (ISO 9001; модель CAF) в Жилинском университете и в факультетах, а также результаты проектов, которые были рассмотрены в области качества в Жилинском университете ( IBAR, DEQUA). Система была внедрена в Жилинский университет в 2013 году и год спустя была внедрена на всех его факультетах.

Основным документом Жилинского университета в отношении качества является Политика качества Университета, сформулирована и утверждена его руководством. Политика качества была разработана в целях качества, которые ориентированы на наиболее важные направления деятельности университета и все сферы, установленные законодательными требованиями. Для целей качества были разработаны измеримые качественные показатели, значения которых изучаются формой опросов во внутренней и внешней среде вуза.

Внутренняя система обеспечения качества образования относится к сфере образования и связи науки и исследования в области образования. Одновременно система учитывает уникальность академической среды и способствует повышению качества процессов управления.